Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol7aB2RT54 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms