Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930402K13RikB1AW18 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930402K13RikB1AW18 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms