Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trabd2bB1ATG9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trabd2bB1ATG9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms