Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cul4bA2A432 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cul4bA2A432 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms