Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trav12-2A0N8N6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trav12-2A0N8N6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trav12-2A0N8N6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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