Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Usp18Q9WTV6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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