Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek3Q9R0A5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nek3Q9R0A5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms