Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rnf4Q9QZS2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf4Q9QZS2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rnf4Q9QZS2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnf4Q9QZS2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf4Q9QZS2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf4Q9QZS2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf4Q9QZS2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rnf4Q9QZS2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rnf4Q9QZS2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Rnf4Q9QZS2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf4Q9QZS2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rnf4Q9QZS2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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