Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpc1Q9QZF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpc1Q9QZF2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms