Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd4Q9QY39 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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