Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxe3Q9QY14 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms