Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx8Q9QXV1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms