Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Nectin3Q9JLB9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms