Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp5Q9JKD3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scamp5Q9JKD3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms