Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MkksQ9JI70 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms