Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ClpxQ9JHS4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ClpxQ9JHS4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms