Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp29Q9ES63 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp29Q9ES63 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp29Q9ES63 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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