Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lima1Q9ERG0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lima1Q9ERG0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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