Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SgshQ9EQ08 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms