Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms