Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgf29Q9DA08 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms