Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubb4aQ9D6F9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms