Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gins2Q9D600 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gins2Q9D600 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms