Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cfap53Q9D439 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cfap53Q9D439 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296.7 ms