Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed11Q9D2R4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed11Q9D2R4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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