Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Trim42Q9D2H5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim42Q9D2H5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms