Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx10Q9CWT3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms