Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lhfpl3Q9CTN8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms