Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard3bQ9CSB4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard3bQ9CSB4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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