Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms