Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Mrpl35Q9CQL6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Mrpl35Q9CQL6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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