Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atp6v0e1Q9CQD8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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