Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cox6cQ9CPQ1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms