Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RetnQ99P87 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms