Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Trem2Q99NH8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trem2Q99NH8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms