Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp26Q99MX1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp26Q99MX1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms