Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lysmd3Q99LE3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms