Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctu1Q99J10 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctu1Q99J10 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms