Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms