Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atl3Q91YH5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms