Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usb1Q91W78 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms