Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csde1Q91W50 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms