Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmcd1Q8VEE1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms