Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pitrm1Q8K411 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms