Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms