Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh2d5Q8JZW5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms