Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms