Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930504O13RikQ8C5Z9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms