Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc187Q8C5V8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc187Q8C5V8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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