Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ctdsp2Q8BX07 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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